Phylogenetic study of the genus Miniopterus.

Authors

  • louiza derouiche ESSAIA
  • Assia Aissi University of blida
  • Khaoula Bouali University of blida

DOI:

https://doi.org/10.46325/gabj.v8i2.395

Keywords:

Miniopterus, GenBank, phylogenetic, bioinformatics, Cytochrome b

Abstract

Avec plus de 1400 espèces dans le monde, le genre Miniopterus (Bonaparte, 1837) est l’un des genres les plus répandus au monde. Diverses études ont indiqué que les relations phylogénétiques entre les espèces de ce genre restent mal comprises en raison de l’apparente uniformité morphologique présentée par le genre, ce qui entrave le consensus sur leur classification et les limites des espèces. Pour y remédier, nous avons mené cette étude phylogénétique à l’aide de divers outils bioinformatiques. Les logiciels utilisés comprennent MEGA pour la reconstruction d’arbres phylogénétiques, DnaSP pour l’identification des haplotypes et NetWork pour les réseaux phylogénétiques. Ces analyses ont été appliquées à des séquences d’ADN mitochondrial du gène « Cytochrome b » obtenues à partir de GenBank pour diverses espèces et sous-espèces de différentes régions géographiques. Les résultats démontrent la monophylie du genre Miniopterus dans deux zones géographiques distinctes, l’une afro-européenne et l’autre australasienne-asiatique. De plus, l’identification morphologique en Algérie indique la présence d’une seule espèce, Miniopterus schreibersii.

References

Bendjoudi D., Yedou W., Beneldjouzi A., Mechouk N., Bendjeddou L. (2019). On bat ectoparasite (nyteribiidae, streblidae, siphonaptera, mesostigmata and ixodidae) from Chrea national park (central atlas mountains), Algeria. Bull. Soc. zool. Fr, 144, 2, p: 67-76.

Burland T., Barratt E., Beaumont M., Racey P. (1999). Population genetic structure and gene flow in a gleaning bat, Plecotus auritus. Biologir Science, 56 (5), p: 1241-1244.

Cardinal B., Christidis L. (2000). Mitochondrial DNA and morphology reveal three geographically distinct lineages of the large bentwing bat (Miniopterus schreibersii) in Australia. Australian Journal of Zoology, 48 p: 1-19.

Christidis L., Goodman S. M., Naughton K., Appleton B. (2014). Insights into the Evolution of a Cryptic Radiation of Bats: Dispersal and Ecological Radiation of Malagasy Miniopterus (Chiroptera: Miniopteridae). Plos One, 9, 3.

Demos T., Webala P., Lutz H., Kerbis J., Peterhans., Steven M. Goodman., Cortés‐Delgado N., Bartonj M., Patterson B. (2019). Multilocus phylogeny of a cryptic radiation of Afrotropical long‐fingered bats (Chiroptera, Miniopteridae). Zoologica Scripta, 49 (1), p: 1-13.

Forster P., Forster M. (2020). Network Release notes. (https://www.fluxus-engineering.com/sharenet_rn.htm).

Joffrin L. (2019). Écologie et évolution de coronavirus dans des populations des chauves-souris des îles de l’ouest de l’océan indien. Thèse de doctorat en sciences du vivant : université de la Réunion, 218p.

Huson D. H., Bryant D. (2012). Application of phylogenetic networks in evolutionary studies. Mol. Biol. Evol, 23(2), p: 254-67.

Izeni P., Guillermo O., Iracilda S., Horacio S., Axel M. (2001). The Cytochrome b Gene as a Phylogenetic Marker : The Limits of Resolution for Analyzing Relationships Among Cichlid Fishes. Molecular Evolition, 53 p: 89-103.

Goodman S., Ramasindrazana B., Schoeman C. (2011). Morphological, bioacoustical, and genetic variation in Miniopterus bats from eastern Madagascar, with the description of a new species. Zootaxa, 2880 p: 1-19.

Khelfaoui F., Kebaci A., Benyacoub S. (2018). Nouvelles données sur les Insecta et les Acarina, ectoparasites des chauves-souris (Mammalia : Chiroptera) en Numidie orientale, Algérie. Bull. Soc. zool. Fr, 143(2), p: 63-73.

Kitchener D. J., Suyanto A. (2002). Morphological variation in Miniopterus pusillus and M. australis (sensu Hill 1992) in southeastern Asia, New Guinea and Australia, Records of the Western Australian Museum, 21 p: 9-33.

Kleppe K., Ohtsuka E., Kleppe R., Molineux I., Khorana H. G. (1971). Studies on polynucleotides. XCVI. Repair replications of short synthetic DNA’s as catalyzed by DNA polymerases. J. Mol. Biol., 56 p: 341-361.

Kowalski K., Rzebick-Kowalska B. (1991). Mammals of Algeria. Polish Academy of Sciences. Institute of Systematics and Evolution of Animals, Wroclaw, 353p.

Li S., Sun K., Lu G., Lin A., Jiang T., Jin L., Hoyt J., Feng J. (2015). Mitochondrial genetic differentiation and morphological difference of Miniopterus fuliginosus and Miniopterus magnater in China and Vietnam. Ecologie and Evoluton, 5(6), p: 1214-1223.

Lord E. (2015). Flux de travaux et leurs applications en bioinformatique. Thèse du doctorat en informatique : université du Québec à Montréal, 4, 233.

Mcccracken G., Mccracken M., Vawter T. (1994). Genetic structure in Migratory populations of the bat Tadarida brasiliensis mexicana. Journal of Mammalogy, 75 (2), p: 500-514.

Messaoud N., Derouiche L., Baha M. (2021). Étude de la dynamique des colonies du grand Rhinolophe (Rhinolophus ferrumequinum, Mammalia, Chiroptera) au parc national de Chréa (Algérie). Revue Agrobiologia 10(1) 29.

Meganathan P. R., Dubey B., Jogayya K. N., Haque I. (2011). Validation of a Multiplex PCR Assay for the Forensic Identification of Indian Crocodiles. J Science médico-légale ; 56(5) p: 1241-4.

Miller-Butterworth C., Murphy W., O’Brien S., Jacobs D., Springer M., Teeling E. (2007). A family matter: conclusive resolution of the taxonomic position of the long-fingered bats, Miniopterus. Mol. Biol. Evol, 24(7), p: 1553-1561.

Nicole W., Steven M., William T., Manule R. (2008). The biogeography of Miniopterus bats (Chiroptera: Miniopteridae) from the Comoro Archipelago inferred from mitochondrial DNA. Molecular Ecology, 17 p: 5205-5219.

Patwardhan A., Ray S., Roy A. (2014). Molecular markers in phylogenetic studies-review. Phylogenetics & Evolutionary Biology, 2, 2.

Petit E., Excoffier L., Mayer F. (1999). No Evidence of bottleneck in the postglacial recolonization of europevby the noctule bat (Nyctalus Noctula). Evolution, 53(4), p: 1247-1258.

Puechmaille S. J., Allegrni B., Benda P., Gurun K., Sramek J., Ibnez C., Just J., Bilgin R. (2014). A new species of the Miniopterus schreibersii species complex (Chiroptera: Miniopteridae) from the Maghreb region, north Africa. Zootaxa, 379(4) 1, p: 108-124.

Rozas J., Ferrer-Mata A., Sanchez-DelBarrio J., Guirao-Rico S., Librado P., Ramos-Onsins S., Sanchez-Gracia (2017). DnaSP 6: DNA Sequence Polymorphism Analysis of Large Data Sets. Mol. Biol. Evol, 34(12), p: 3299-3302.

Saitou N., Nei M. (1987). The Neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees. Neighbor-Joining method, 4, 4.

Sayers E., Cavanaugh M, Clark K., Pruitt K., Schoch C., Sherry S., Karsch-Mizrachi I. (2020). GenBank. Nucleic Acids Research, 49(10). 1093p.

Stevens R., Willig M., Richard E., Strauss., Lundberg P. (2006). Latitudinal Gradients in the Phenetic diversity of new world bat communities. Oikos, 112 p: 41-50.

Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. (2011). MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Molecular Biology and Evolution, 28(10), p: 2731-2739.

Teeling E. C., Springer M. S., Madsen O., Bates P., O'Brien S. J., Murphy W. J. (2005). A molecular phylogeny for bats illuminates biogeography and the fossil record. Science, Vol. 307, Issue 5709, p: 580-584.

Villesen P. (2007). FaBox: an online toolbox for FASTA sequences. Molecular Ecology Notes, 7 p: 965-968.

Yoann M. (2012). Les arbres phylogénétiques : construction et interprétation. Bioinf-fr.net Geekus biologicus.

Yvan S., Inaki I., Pedro L. (2007). A review of feature selection techniques in bioinformatics. Bioinformatics, 23(19), p: 2507-2517.

Downloads

Published

08/08/2024

How to Cite

derouiche, louiza, Aissi, A., & Bouali, K. (2024). Phylogenetic study of the genus Miniopterus. Genetics & Biodiversity Journal, 8(2), 23–36. https://doi.org/10.46325/gabj.v8i2.395

Issue

Section

Original Article

Most read articles by the same author(s)